MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-64 chromosome

Total Repeats: 10243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016948	CGC	2	6	3096332	3096337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_016948	CACT	2	8	3096378	3096385	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_016948	CGA	2	6	3097130	3097135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_016948	CG	3	6	3100375	3100380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_016948	TA	3	6	3100391	3100396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016948	CGAC	2	8	3100424	3100431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_016948	GGA	2	6	3100475	3100480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016948	GC	4	8	3104361	3104368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_016948	GCG	2	6	3104395	3104400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_016948	CGT	2	6	3105261	3105266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_016948	CCA	2	6	3105267	3105272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_016948	CCA	2	6	3105349	3105354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_016948	GAG	2	6	3107040	3107045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_016948	CTCAT	2	10	3108403	3108412	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6015	NC_016948	TCA	2	6	3108472	3108477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_016948	GA	3	6	3108503	3108508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_016948	A	7	7	3110800	3110806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016948	AGT	2	6	3111942	3111947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016948	AGG	2	6	3111962	3111967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016948	CGGTG	2	10	3112017	3112026	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6021	NC_016948	CGG	2	6	3112066	3112071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_016948	GTC	2	6	3114083	3114088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_016948	CA	3	6	3114093	3114098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_016948	CGG	2	6	3114205	3114210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016948	CATT	2	8	3114211	3114218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_016948	CTGT	2	8	3114220	3114227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_016948	CGA	2	6	3114260	3114265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_016948	CGC	2	6	3114295	3114300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_016948	CGT	2	6	3114329	3114334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_016948	TGTC	2	8	3114396	3114403	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_016948	CGG	2	6	3114410	3114415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016948	GAC	2	6	3114596	3114601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_016948	GTCGC	2	10	3114602	3114611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6034	NC_016948	TGG	2	6	3125516	3125521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016948	CGG	2	6	3125523	3125528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_016948	TGA	2	6	3125795	3125800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016948	GATC	2	8	3125805	3125812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_016948	AGCCG	2	10	3125916	3125925	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6039	NC_016948	CTT	2	6	3125955	3125960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_016948	AT	3	6	3126022	3126027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016948	CGC	2	6	3126033	3126038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_016948	TAAAA	2	10	3126088	3126097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016948	TGG	2	6	3126187	3126192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016948	GCG	2	6	3126243	3126248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_016948	AGG	2	6	3126255	3126260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016948	TGG	2	6	3126277	3126282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016948	CCG	2	6	3126316	3126321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_016948	CGG	2	6	3126367	3126372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_016948	AGA	2	6	3126498	3126503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016948	TGA	2	6	3126600	3126605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016948	GAC	2	6	3126610	3126615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_016948	CGG	2	6	3126633	3126638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_016948	GCCT	2	8	3126698	3126705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_016948	TCC	2	6	3126711	3126716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_016948	CGGT	2	8	3126723	3126730	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6056	NC_016948	CG	4	8	3126836	3126843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_016948	GC	3	6	3126881	3126886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_016948	CGC	2	6	3126898	3126903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_016948	TTG	2	6	3127464	3127469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016948	TCA	2	6	3127480	3127485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_016948	CGG	2	6	3127499	3127504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_016948	GACGA	2	10	3127538	3127547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6063	NC_016948	TTC	2	6	3127575	3127580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_016948	ACG	2	6	3127584	3127589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_016948	GCG	2	6	3127590	3127595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_016948	TCG	2	6	3127629	3127634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_016948	GCCTC	2	10	3127641	3127650	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6068	NC_016948	CGA	2	6	3127711	3127716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_016948	ACG	2	6	3127749	3127754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_016948	ACT	2	6	3127758	3127763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_016948	GCC	2	6	3128010	3128015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_016948	AACC	2	8	3128023	3128030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_016948	GAT	2	6	3128102	3128107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_016948	GGC	2	6	3128138	3128143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_016948	TGTC	2	8	3128156	3128163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_016948	GC	3	6	3128248	3128253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_016948	AGG	2	6	3128284	3128289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_016948	TGA	2	6	3129108	3129113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016948	ACCC	2	8	3129231	3129238	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6080	NC_016948	CGTTG	2	10	3129263	3129272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6081	NC_016948	GC	3	6	3130040	3130045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_016948	CCG	2	6	3130064	3130069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_016948	GCGA	2	8	3130075	3130082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6084	NC_016948	GCG	2	6	3130086	3130091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_016948	CCT	2	6	3130549	3130554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_016948	GAA	2	6	3130581	3130586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_016948	CTGTT	2	10	3130612	3130621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6088	NC_016948	CCAA	2	8	3130659	3130666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_016948	CA	3	6	3130668	3130673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_016948	TCA	2	6	3130683	3130688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_016948	AGG	2	6	3130715	3130720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_016948	CGC	2	6	3131234	3131239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_016948	CTG	2	6	3131339	3131344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_016948	CCA	2	6	3131363	3131368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_016948	AAC	2	6	3132863	3132868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_016948	TTCG	2	8	3132884	3132891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_016948	GATGT	2	10	3132899	3132908	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_016948	ACT	2	6	3132912	3132917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_016948	AGT	2	6	3132918	3132923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016948	ACCG	2	8	3132979	3132986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_016948	GAC	2	6	3132992	3132997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_016948	GAG	2	6	3133059	3133064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016948	A	6	6	3133113	3133118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016948	CTA	2	6	3133442	3133447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_016948	CGAC	2	8	3133487	3133494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_016948	GCTCA	2	10	3133551	3133560	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6107	NC_016948	GGAG	2	8	3133768	3133775	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016948	CGGT	2	8	3133780	3133787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_016948	GCC	2	6	3133811	3133816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_016948	CCGA	2	8	3133852	3133859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_016948	ACC	2	6	3133970	3133975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_016948	TCT	2	6	3134149	3134154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_016948	TCAG	2	8	3134187	3134194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_016948	GCA	2	6	3134277	3134282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_016948	TTCG	2	8	3134459	3134466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_016948	GCC	2	6	3134577	3134582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_016948	ACC	2	6	3134596	3134601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_016948	GC	3	6	3134611	3134616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_016948	GCC	2	6	3134629	3134634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_016948	GC	3	6	3134638	3134643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_016948	CGT	2	6	3134663	3134668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_016948	GC	3	6	3135047	3135052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_016948	ACG	2	6	3135068	3135073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_016948	CG	3	6	3135099	3135104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_016948	GCT	2	6	3135257	3135262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_016948	CCG	2	6	3135275	3135280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_016948	TG	3	6	3135462	3135467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_016948	CG	3	6	3135474	3135479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_016948	CGG	2	6	3135484	3135489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_016948	CGGCG	2	10	3135525	3135534	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6131	NC_016948	GTC	2	6	3135541	3135546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_016948	CG	3	6	3135556	3135561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6133	NC_016948	GC	3	6	3135580	3135585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6256	NC_016948	CGG	2	6	3214304	3214309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6263	NC_016948	CGGC	2	8	3220370	3220377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6266	NC_016948	GC	3	6	3222560	3222565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6267	NC_016948	CGG	2	6	3223385	3223390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6393	NC_016948	CATTA	2	10	3320444	3320453	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6394	NC_016948	TGCCA	2	10	3323374	3323383	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6395	NC_016948	C	6	6	3323760	3323765	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6396	NC_016948	CCA	2	6	3323841	3323846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6400	NC_016948	GCCA	2	8	3324197	3324204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6401	NC_016948	GCG	2	6	3324223	3324228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_016948	GGCCG	2	10	3324272	3324281	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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6419	NC_016948	CG	3	6	3335369	3335374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6425	NC_016948	GCG	2	6	3338773	3338778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6432	NC_016948	GCG	2	6	3342742	3342747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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